Álvarez, que desde 2010 es vicepresidenta del Banco Europeo de Inversiones (BEI), ha sido imputada junto a otras 20 personas por el fraude de los ERE que se habría producido en 2000 y que habría afectado a las prejubilaciones de unas 70 empresas. Los fondos desviados ascienden a unos 136 millones de euros.
La magistrada imputa a Álvarez por la forma en la que se realizaron las transferencias de financiación. En esta última imputación hay otros 17 altos o exaltos cargos de consejerías andaluzas. La juez del caso lleva ya 3 años de instrucción previa y ha imputado a 73 personas.
Magdalena Álvarez ha sido consejera de Economía, ministra de Fomento con el gobierno de Rodríguez Zapatero, europarlamentaria y en la actualidad vicepresidenta del BEI.